docs: refinamento integral da documentação didática

Índices por jornada, convenções, diagramas Mermaid, correções de
arquitetura (MainShellFrame, TCP/PluginManager), tutoriais com
verificações e troubleshooting; remove redirect pitiupi/docs.

Co-authored-by: Cursor <cursoragent@cursor.com>
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# Referências — Pitiupi
Bibliografia e notas curtas para apoiar a disciplina de Redes de Computadores.
Bibliografia e notas curtas para apoiar a disciplina de Redes de Computadores. **Fonte única** para citações longas — capítulos em `documentation/` linkam aqui em vez de repetir bibliografia.
**Sugestões de livro-texto:** Kurose & Ross — *Redes de Computadores e a Internet*; Tanenbaum — *Redes de Computadores*; Peterson & Davie — *Redes de Computadores*.
**RFCs úteis:** UDP (768), TCP (793), IP multicast (1112, 3376). Documentação Java: [Serialization](https://docs.oracle.com/en/java/javase/17/docs/specs/serialization/index.html), [SPI](https://docs.oracle.com/en/java/javase/17/docs/api/java.base/java/util/ServiceLoader.html), sockets e Swing EDT.
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